Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE12Q6L8Q7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms