RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331444.10

DGCR6-201, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DGCR6, Length 1,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-201ENST00000331444 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.07■■■■■ 5.29
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DGCR6-201ENST00000331444 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.33■■■■■ 4.21
DGCR6-201ENST00000331444 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.1■■■■■ 4.17
DGCR6-201ENST00000331444 NACADO15069 1562 aa41■■■■■ 4.15
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DGCR6-201ENST00000331444 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
DGCR6-201ENST00000331444 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.4■■■■■ 4.06
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DGCR6-201ENST00000331444 SCRIBQ14160 1630 aa39.33■■■■□ 3.89
DGCR6-201ENST00000331444 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.21■■■■□ 3.87
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DGCR6-201ENST00000331444 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
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DGCR6-201ENST00000331444 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.2■■■■□ 3.39
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DGCR6-201ENST00000331444 OSCARQ8IYS5 282 aa35.79■■■■□ 3.32
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DGCR6-201ENST00000331444 IFT140Q96RY7 1462 aa35.57■■■■□ 3.28
DGCR6-201ENST00000331444 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
DGCR6-201ENST00000331444 TOPBP1Q92547 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
DGCR6-201ENST00000331444 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-201ENST00000331444 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-201ENST00000331444 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-201ENST00000331444 ABCC8Q09428 1581 aa35.42■■■■□ 3.26
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DGCR6-201ENST00000331444 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.93■■■■□ 3.18
DGCR6-201ENST00000331444 WDR97A6NE52 1622 aa34.92■■■■□ 3.18
DGCR6-201ENST00000331444 SOGA1O94964 1423 aa34.9■■■■□ 3.18
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DGCR6-201ENST00000331444 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
DGCR6-201ENST00000331444 FBLN2P98095 1184 aa34.82■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 CUX1P39880 1505 aa34.81■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.8■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.78■■■■□ 3.16
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DGCR6-201ENST00000331444 PBRM1Q86U86 1689 aa34.6■■■■□ 3.13
DGCR6-201ENST00000331444 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
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DGCR6-201ENST00000331444 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
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DGCR6-201ENST00000331444 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
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DGCR6-201ENST00000331444 NUP160Q12769 1436 aa34.18■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 CEP170Q5SW79 1584 aa34.16■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 SHROOM2Q13796 1616 aa34.12■■■■□ 3.05
DGCR6-201ENST00000331444 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
DGCR6-201ENST00000331444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.05■■■■□ 3.04
DGCR6-201ENST00000331444 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
DGCR6-201ENST00000331444 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.85■■■■□ 3.01
DGCR6-201ENST00000331444 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
DGCR6-201ENST00000331444 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
DGCR6-201ENST00000331444 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.75■■■□□ 2.99
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