RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446941.2

ABCC5-211, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCC5, Length 883 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5-211ENST00000446941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.6■■■■■ 5.21
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ABCC5-211ENST00000446941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.01■■■■□ 3.99
ABCC5-211ENST00000446941 NACADO15069 1562 aa39.92■■■■□ 3.98
ABCC5-211ENST00000446941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.91■■■■□ 3.98
ABCC5-211ENST00000446941 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
ABCC5-211ENST00000446941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
ABCC5-211ENST00000446941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.39■■■■□ 3.9
ABCC5-211ENST00000446941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.96■■■■□ 3.83
ABCC5-211ENST00000446941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.82
ABCC5-211ENST00000446941 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.76■■■■□ 3.8
ABCC5-211ENST00000446941 SCRIBQ14160 1630 aa38.64■■■■□ 3.78
ABCC5-211ENST00000446941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.43■■■■□ 3.74
ABCC5-211ENST00000446941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.41■■■■□ 3.74
ABCC5-211ENST00000446941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
ABCC5-211ENST00000446941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.66■■■■□ 3.62
ABCC5-211ENST00000446941 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.49■■■■□ 3.59
ABCC5-211ENST00000446941 SMARCA4P51532 1647 aa36.95■■■■□ 3.51
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ABCC5-211ENST00000446941 NCAPD3P42695 1498 aa36.86■■■■□ 3.49
ABCC5-211ENST00000446941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.83■■■■□ 3.49
ABCC5-211ENST00000446941 SMARCA2P51531 1590 aa36.78■■■■□ 3.48
ABCC5-211ENST00000446941 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.66■■■■□ 3.46
ABCC5-211ENST00000446941 HMGXB3Q12766 1538 aa36.64■■■■□ 3.46
ABCC5-211ENST00000446941 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.61■■■■□ 3.45
ABCC5-211ENST00000446941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
ABCC5-211ENST00000446941 WIZO95785 1651 aa36.23■■■■□ 3.39
ABCC5-211ENST00000446941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ABCC5-211ENST00000446941 NESP48681 1621 aa35.98■■■■□ 3.35
ABCC5-211ENST00000446941 ERCC6Q03468 1493 aa35.98■■■■□ 3.35
ABCC5-211ENST00000446941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.89■■■■□ 3.34
ABCC5-211ENST00000446941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ABCC5-211ENST00000446941 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.78■■■■□ 3.32
ABCC5-211ENST00000446941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.71■■■■□ 3.31
ABCC5-211ENST00000446941 CUX2O14529 1486 aa35.65■■■■□ 3.3
ABCC5-211ENST00000446941 CFTRP13569 1480 aa35.52■■■■□ 3.28
ABCC5-211ENST00000446941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.49■■■■□ 3.27
ABCC5-211ENST00000446941 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.47■■■■□ 3.27
ABCC5-211ENST00000446941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
ABCC5-211ENST00000446941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.35■■■■□ 3.25
ABCC5-211ENST00000446941 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.34■■■■□ 3.25
ABCC5-211ENST00000446941 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.32■■■■□ 3.24
ABCC5-211ENST00000446941 WDR62O43379 1518 aa35.19■■■■□ 3.22
ABCC5-211ENST00000446941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
ABCC5-211ENST00000446941 PRDM2Q13029 1718 aa35.1■■■■□ 3.21
ABCC5-211ENST00000446941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
ABCC5-211ENST00000446941 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.81■■■■□ 3.16
ABCC5-211ENST00000446941 ABCC8Q09428 1581 aa34.79■■■■□ 3.16
ABCC5-211ENST00000446941 TOPBP1Q92547 1522 aa34.76■■■■□ 3.15
ABCC5-211ENST00000446941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.69■■■■□ 3.14
ABCC5-211ENST00000446941 IFT140Q96RY7 1462 aa34.61■■■■□ 3.13
ABCC5-211ENST00000446941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
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ABCC5-211ENST00000446941 CUX1P39880 1505 aa34.4■■■■□ 3.1
ABCC5-211ENST00000446941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
ABCC5-211ENST00000446941 SOGA1O94964 1423 aa34.34■■■■□ 3.09
ABCC5-211ENST00000446941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.33■■■■□ 3.09
ABCC5-211ENST00000446941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.29■■■■□ 3.08
ABCC5-211ENST00000446941 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
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ABCC5-211ENST00000446941 OSCARQ8IYS5 282 aa34.18■■■■□ 3.06
ABCC5-211ENST00000446941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.16■■■■□ 3.06
ABCC5-211ENST00000446941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
ABCC5-211ENST00000446941 WDR97A6NE52 1622 aa34.11■■■■□ 3.05
ABCC5-211ENST00000446941 TOP2BQ02880 1626 aa34.06■■■■□ 3.04
ABCC5-211ENST00000446941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.03■■■■□ 3.04
ABCC5-211ENST00000446941 SYNJ1O43426 1573 aa34.02■■■■□ 3.04
ABCC5-211ENST00000446941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34■■■■□ 3.03
ABCC5-211ENST00000446941 GRIN2BQ13224 1484 aa33.95■■■■□ 3.03
ABCC5-211ENST00000446941 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.93■■■■□ 3.02
ABCC5-211ENST00000446941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.91■■■■□ 3.02
ABCC5-211ENST00000446941 FBLN2P98095 1184 aa33.91■■■■□ 3.02
ABCC5-211ENST00000446941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
ABCC5-211ENST00000446941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.85■■■■□ 3.01
ABCC5-211ENST00000446941 CHD1O14646 1710 aa33.82■■■■□ 3
ABCC5-211ENST00000446941 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
ABCC5-211ENST00000446941 PBRM1Q86U86 1689 aa33.77■■■■□ 3
ABCC5-211ENST00000446941 SYNJ2O15056 1496 aa33.76■■■□□ 2.99
ABCC5-211ENST00000446941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.59■■■□□ 2.97
ABCC5-211ENST00000446941 TRIM41Q8WV44 630 aa33.58■■■□□ 2.97
ABCC5-211ENST00000446941 ARHGEF11O15085 1522 aa33.57■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.55■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.55■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.55■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 ADAMTS12P58397 1594 aa33.54■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.53■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.52■■■□□ 2.96
ABCC5-211ENST00000446941 GRIN2AQ12879 1464 aa33.5■■■□□ 2.95
ABCC5-211ENST00000446941 KIF27Q86VH2 1401 aa33.47■■■□□ 2.95
ABCC5-211ENST00000446941 NUP160Q12769 1436 aa33.36■■■□□ 2.93
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ABCC5-211ENST00000446941 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.32■■■□□ 2.92
ABCC5-211ENST00000446941 CEP170Q5SW79 1584 aa33.3■■■□□ 2.92
ABCC5-211ENST00000446941 ARAP1Q96P48 1450 aa33.27■■■□□ 2.92
ABCC5-211ENST00000446941 CUL7Q14999 1698 aa33.23■■■□□ 2.91
ABCC5-211ENST00000446941 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.15■■■□□ 2.9
ABCC5-211ENST00000446941 SHROOM2Q13796 1616 aa33.09■■■□□ 2.89
ABCC5-211ENST00000446941 JPH4Q96JJ6 628 aa33.05■■■□□ 2.88
ABCC5-211ENST00000446941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.05■■■□□ 2.88
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