Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOHLH1Q5JUK2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms