Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 MRP10YDL045W-A 288 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YFH1YDL120W 525 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 COX7YMR256C 183 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YPR039WYPR039W 336 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YPR177CYPR177C 372 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 snR41snR41 95 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 VMA9YCL005W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 SOK2YMR016C 2358 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 CDC53YDL132W 2448 nt2.3□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 IRC10YOL015W 1761 nt2.29□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 RAV1YJR033C 4074 nt2.29□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YLR269CYLR269C 351 nt2.29□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 TSC3YBR058C-A 243 nt2.29□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 NEO1YIL048W 3456 nt2.29□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 LYS9YNR050C 1341 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YHL037CYHL037C 402 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 NBL1YHR199C-A 222 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 TEN1YLR010C 483 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YMR324CYMR324C 243 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 YOR392WYOR392W 444 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 RPB5YBR154C 648 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 CTF4YPR135W 2784 nt2.28□□□□□ -2.04
CTI6Q08923 NIC96YFR002W 2520 nt2.27□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 ATP17YDR377W 306 nt2.27□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 snR13snR13 124 nt2.27□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 RTC6YPL183W-A 282 nt2.27□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 MET18YIL128W 3099 nt2.27□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 TOR2YKL203C 7425 nt2.26□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 ELG1YOR144C 2376 nt2.26□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 SEC22YLR268W 645 nt2.26□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 SET2YJL168C 2202 nt2.26□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YPR097WYPR097W 3222 nt2.26□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 CRM1YGR218W 3255 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 COS111YBR203W 2775 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YGR025WYGR025W 303 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 IRC20YLR247C 4671 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 SNC2YOR327C 348 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 VPS35YJL154C 2835 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 MSS11YMR164C 2277 nt2.25□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 SPC72YAL047C 1869 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 MMS22YLR320W 4365 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 SWT1YOR166C 1377 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 snR79snR79 84 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 LSO2YGR169C-A 279 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YOR333CYOR333C 417 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 KAR3YPR141C 2190 nt2.24□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 TUS1YLR425W 3924 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 VPH1YOR270C 2523 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 SPO22YIL073C 2928 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YKL063CYKL063C 504 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YLR101CYLR101C 396 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YNL324WYNL324W 396 nt2.23□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YSW1YBR148W 1830 nt2.22□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 PEP1YBL017C 4740 nt2.22□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 RIC1YLR039C 3171 nt2.22□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 HUR1YGL168W 333 nt2.22□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.22□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 MNE1YOR350C 1992 nt2.21□□□□□ -2.05
CTI6Q08923 RRT1YBL048W 312 nt2.21□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 GDS1YOR355W 1569 nt2.21□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 SGD1YLR336C 2700 nt2.21□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 NUP120YKL057C 3114 nt2.21□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 TRL1YJL087C 2484 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 TOF1YNL273W 3717 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YDR286CYDR286C 345 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YER121WYER121W 345 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 RPS18BYML026C 441 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 CMC2YBL059C-A 330 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 CDC24YAL041W 2565 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 COX1Q0045 1605 nt2.2□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 SIR4YDR227W 4077 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YDL118WYDL118W 381 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 IES5YER092W 378 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YBL012CYBL012C 402 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YBR032WYBR032W 303 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 GPX2YBR244W 489 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 RUD3YOR216C 1455 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 CDC27YBL084C 2277 nt2.19□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YGL069CYGL069C 465 nt2.18□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 TIF11YMR260C 462 nt2.18□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 CDC33YOL139C 642 nt2.18□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 IST2YBR086C 2841 nt2.18□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YMR045CYMR045C 5268 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 RTT101YJL047C 2529 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 HOP2YGL033W 657 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YGR042WYGR042W 816 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YHR210CYHR210C 1026 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 EGD1YPL037C 474 nt2.17□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 HSL1YKL101W 4557 nt2.16□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 CDC60YPL160W 3273 nt2.16□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 YFL019CYFL019C 354 nt2.16□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 CRG1YHR209W 876 nt2.16□□□□□ -2.06
CTI6Q08923 FCF2YLR051C 654 nt2.16□□□□□ -2.06
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