Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 GIM5YML094W 492 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 RTC6YPL183W-A 282 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 UFD2YDL190C 2886 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 SWT1YOR166C 1377 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 MSS11YMR164C 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 SEF1YBL066C 3447 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 VPS63YLR261C 327 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YML003WYML003W 873 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 PKR1YMR123W 369 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YBL083CYBL083C 426 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 TFB6YOR352W 1032 nt0.9□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 SNF5YBR289W 2718 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YGR130CYGR130C 2451 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 SMY1YKL079W 1971 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 MZM1YDR493W 372 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RPL29YFR032C-A 180 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RAD6YGL058W 519 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 LSM12YHR121W 564 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 MUK1YPL070W 1839 nt0.89□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 CDC39YCR093W 6327 nt0.88□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 GUP1YGL084C 1683 nt0.88□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 HTB1YDR224C 396 nt0.88□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RSM28YDR494W 1086 nt0.88□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 PHO80YOL001W 882 nt0.88□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 BEM2YER155C 6504 nt0.88□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 UBP3YER151C 2739 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 VPS74YDR372C 1038 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YEL057CYEL057C 702 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 CUP1-1YHR053C 186 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 CUP1-2YHR055C 186 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 EMC5YIL027C 426 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RPC25YKL144C 639 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 GPX2YBR244W 489 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 NOT5YPR072W 1683 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 KAR9YPL269W 1935 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 NUP188YML103C 4968 nt0.87□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 SCC2YDR180W 4482 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 SMC1YFL008W 3678 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 ANS1YHR126C 480 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RPL40BYKR094C 387 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 LCL2YLR104W 396 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 OST2YOR103C 393 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 IFH1YLR223C 3258 nt0.86□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 VPS54YDR027C 2670 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 BUD26YDR241W 288 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RSM18YER050C 417 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 COX3Q0275 810 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 RPS18BYML026C 441 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YMR324CYMR324C 243 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YNL010WYNL010W 726 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 HHT1YBR010W 411 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YOR376WYOR376W 369 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YPL039WYPL039W 951 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.85□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 snR59snR59 78 nt0.84□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.84□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 SPC1YJR010C-A 285 nt0.84□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 CGI121YML036W 546 nt0.84□□□□□ -2.27
HRD1Q08109 SEC3YER008C 4011 nt0.84□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 DOP1YDR141C 5097 nt0.84□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 PRP16YKR086W 3216 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YDL211CYDL211C 1119 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 DAD1YDR016C 285 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 BET4YJL031C 984 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 HYM1YKL189W 1200 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 BRX1YOL077C 876 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YBR224WYBR224W 516 nt0.83□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 IRC2YDR112W 309 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YLL020CYLL020C 306 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 SEC22YLR268W 645 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 TIM18YOR297C 579 nt0.82□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 MAK10YEL053C 2202 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 DPB11YJL090C 2295 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 TTI1YKL033W 3117 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 RTR1YER139C 681 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 RNR4YGR180C 1038 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 NUP82YJL061W 2142 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 CMC1YKL137W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 CMS1YLR003C 876 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 RPS7BYNL096C 573 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 HCH1YNL281W 462 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 SHE4YOR035C 2370 nt0.81□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 STB6YKL072W 2301 nt0.8□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YER121WYER121W 345 nt0.8□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.8□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.8□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 EAF1YDR359C 2949 nt0.8□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 ZRG17YNR039C 1818 nt0.8□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 SPR3YGR059W 1539 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 SEC5YDR166C 2916 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YDR115WYDR115W 318 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 URA10YMR271C 684 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YNL235CYNL235C 432 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.7 ms