Protein–RNA interactions for Protein: Q06333

CNL1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit CNL1, yeastyeast

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNL1Q06333 GDS1YOR355W 1569 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 ESA1YOR244W 1338 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 SGO1YOR073W 1773 nt0.55□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 UTP13YLR222C 2454 nt0.55□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 RPL9BYNL067W 576 nt0.55□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 RTC6YPL183W-A 282 nt0.55□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 SPT21YMR179W 2277 nt0.55□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 SWT1YOR166C 1377 nt0.55□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 KIP1YBL063W 3336 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 NHP2YDL208W 471 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 LSM4YER112W 564 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 ICS2YBR157C 768 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YBR224WYBR224W 516 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 CLU1YMR012W 3834 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 PIP2YOR363C 2991 nt0.54□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 BUD3YCL014W 4911 nt0.53□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 CYC7YEL039C 342 nt0.53□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YHL037CYHL037C 402 nt0.53□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 CDC24YAL041W 2565 nt0.52□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 UBC9YDL064W 474 nt0.52□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 RCN1YKL159C 636 nt0.52□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 TMA10YLR327C 261 nt0.52□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YML003WYML003W 873 nt0.52□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 PET20YPL159C 762 nt0.52□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YDL073WYDL073W 2955 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YDR521WYDR521W 336 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YGR242WYGR242W 309 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 RPL16AYIL133C 600 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 PEP8YJL053W 1140 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 SLS1YLR139C 1932 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 CMC4YMR194C-B 222 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 FMP23YBR047W 528 nt0.51□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 KAR9YPL269W 1935 nt0.5□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YOR105WYOR105W 327 nt0.5□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 IRC14YOR135C 342 nt0.5□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YPL039WYPL039W 951 nt0.5□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 DPB11YJL090C 2295 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 NUP157YER105C 4176 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 SMB1YER029C 591 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 GEP7YGL057C 864 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 DDR48YMR173W 1293 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YPL034WYPL034W 498 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 ROX1YPR065W 1107 nt0.49□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 TOF2YKR010C 2316 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 PEP3YLR148W 2757 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YDR248CYDR248C 582 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YGR265WYGR265W 411 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 PHO80YOL001W 882 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 snR24snR24 89 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 SHE4YOR035C 2370 nt0.48□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 REV3YPL167C 4515 nt0.47□□□□□ -2.33
CNL1Q06333 YEL010WYEL010W 351 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 MXR1YER042W 555 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 RPL38YLR325C 237 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YOL118CYOL118C 309 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 RIM20YOR275C 1986 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 NCS2YNL119W 1482 nt0.46□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 PAU2YEL049W 363 nt0.45□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 RAD6YGL058W 519 nt0.45□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 HOT13YKL084W 351 nt0.45□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 SEC22YLR268W 645 nt0.45□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 ATP15YPL271W 189 nt0.45□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 RKR1YMR247C 4689 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 NGG1YDR176W 2109 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 SVP26YHR181W 687 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 BET4YJL031C 984 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 SMD3YLR147C 306 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YOR169CYOR169C 465 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YJR098CYJR098C 1971 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 LST4YKL176C 2487 nt0.44□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 SWF1YDR126W 1011 nt0.43□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 RPS16AYMR143W 432 nt0.43□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 RIO2YNL207W 1278 nt0.43□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.43□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 BMT5YIL096C 1011 nt0.42□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 LCL2YLR104W 396 nt0.42□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 SPC24YMR117C 642 nt0.42□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YBL073WYBL073W 312 nt0.42□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YBL108WYBL108W 306 nt0.42□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 TTI1YKL033W 3117 nt0.42□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 NUT1YGL151W 3399 nt0.41□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 snR83snR83 306 nt0.41□□□□□ -2.34
CNL1Q06333 YLR366WYLR366W 306 nt0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 125.7 ms