Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 RCN2YOR220W 798 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 YPR153WYPR153W 423 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 YDR114CYDR114C 303 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 SPC1YJR010C-A 285 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 CCE1YKL011C 1062 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 snR161snR161 161 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 CLB5YPR120C 1308 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.53□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 SWI5YDR146C 2130 nt-0.53□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 YLR042CYLR042C 486 nt-0.53□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 DLT1YMR126C 1029 nt-0.53□□□□□ -2.49
TOM1Q03280 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.54□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 RPB5YBR154C 648 nt-0.54□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 NOC3YLR002C 1992 nt-0.54□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 BDP1YNL039W 1785 nt-0.54□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt-0.54□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YAR068WYAR068W 486 nt-0.54□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YNL109WYNL109W 546 nt-0.55□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YOP1YPR028W 543 nt-0.55□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 SBH2YER019C-A 267 nt-0.55□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YPR148CYPR148C 1308 nt-0.55□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 PEX27YOR193W 1131 nt-0.56□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 EFR3YMR212C 2349 nt-0.56□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 MUB1YMR100W 1863 nt-0.56□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YGR149WYGR149W 1299 nt-0.56□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 IRC23YOR044W 474 nt-0.56□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 SMD1YGR074W 441 nt-0.57□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 IST1YNL265C 897 nt-0.57□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 TGL2YDR058C 981 nt-0.58□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 HOT13YKL084W 351 nt-0.58□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 ALG5YPL227C 1005 nt-0.58□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 CRM1YGR218W 3255 nt-0.58□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 GRX7YBR014C 612 nt-0.58□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 RFX1YLR176C 2436 nt-0.59□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 RPS7BYNL096C 573 nt-0.59□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 YKL100CYKL100C 1764 nt-0.59□□□□□ -2.5
TOM1Q03280 SRB4YER022W 2064 nt-0.6□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YJL202CYJL202C 348 nt-0.61□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YFR045WYFR045W 930 nt-0.62□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt-0.62□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YJR011CYJR011C 786 nt-0.62□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 LAP3YNL239W 1365 nt-0.62□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 RPL37BYDR500C 267 nt-0.63□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YUH1YJR099W 711 nt-0.63□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 PUS9YDL036C 1389 nt-0.63□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt-0.64□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YFL063WYFL063W 456 nt-0.64□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 EST1YLR233C 2100 nt-0.64□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 FYV6YNL133C 522 nt-0.65□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 OSH6YKR003W 1347 nt-0.65□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 APC5YOR249C 2058 nt-0.65□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 FUS1YCL027W 1539 nt-0.65□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 SWS2YNL081C 432 nt-0.65□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YEL073CYEL073C 324 nt-0.66□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 YPR170CYPR170C 336 nt-0.66□□□□□ -2.51
TOM1Q03280 VMA7YGR020C 357 nt-0.66□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 RNP1YLL046C 750 nt-0.66□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 RRT7YLL030C 342 nt-0.67□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.67□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YMR31YFR049W 372 nt-0.67□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.67□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 LSM7YNL147W 348 nt-0.67□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 EFG1YGR271C-A 702 nt-0.68□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 MVP1YMR004W 1536 nt-0.68□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 COX1Q0045 1605 nt-0.68□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt-0.69□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YLR282CYLR282C 342 nt-0.69□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 SLS1YLR139C 1932 nt-0.69□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YLR402WYLR402W 192 nt-0.69□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 NTF2YER009W 378 nt-0.7□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 UBC5YDR059C 447 nt-0.7□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 SFM1YOR021C 642 nt-0.71□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 TFB6YOR352W 1032 nt-0.71□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 VMA22YHR060W 546 nt-0.71□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YKL177WYKL177W 339 nt-0.71□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YJL022WYJL022W 309 nt-0.72□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 CUL3YGR003W 2235 nt-0.72□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 SLD5YDR489W 885 nt-0.72□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 YIL161WYIL161W 708 nt-0.72□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 UPS2YLR168C 693 nt-0.72□□□□□ -2.52
TOM1Q03280 HYM1YKL189W 1200 nt-0.72□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 RPB10YOR210W 213 nt-0.73□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 NOP19YGR251W 591 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YLR444CYLR444C 303 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YOR015WYOR015W 360 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YSW1YBR148W 1830 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YIL086CYIL086C 309 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 CDC33YOL139C 642 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 STO1YMR125W 2586 nt-0.74□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 RPS26AYGL189C 360 nt-0.75□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 MUS81YDR386W 1899 nt-0.75□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 SEC8YPR055W 3198 nt-0.75□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 CSI2YOL007C 1026 nt-0.76□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 MFB1YDR219C 1398 nt-0.76□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 NOP53YPL146C 1368 nt-0.76□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 BUR2YLR226W 1188 nt-0.76□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 SBH1YER087C-B 249 nt-0.76□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YER066C-AYER066C-A 501 nt-0.77□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 MMS21YEL019C 804 nt-0.77□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90.4 ms