Protein–RNA interactions for Protein: P36062

AVT3, Vacuolar amino acid transporter 3, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT3P36062 PXA2YKL188C 2562 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT3P36062 FAP7YDL166C 594 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT3P36062 RPL28YGL103W 450 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT3P36062 AHC1YOR023C 1701 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT3P36062 EPL1YFL024C 2499 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT3P36062 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT3P36062 CRT10YOL063C 2874 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT3P36062 SLY1YDR189W 2001 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT3P36062 MSC6YOR354C 2079 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YER039C-AYER039C-A 219 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT3P36062 TOM5YPR133W-A 153 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT3P36062 SWI1YPL016W 3945 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT3P36062 VPS35YJL154C 2835 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT3P36062 SMY1YKL079W 1971 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT3P36062 ATG13YPR185W 2217 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT3P36062 ERB1YMR049C 2424 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT3P36062 RRM3YHR031C 2172 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT3P36062 RAD1YPL022W 3303 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT3P36062 LYP1YNL268W 1836 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YFR016CYFR016C 3702 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT3P36062 ATP7YKL016C 525 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YBL012CYBL012C 402 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT3P36062 CHO2YGR157W 2610 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT3P36062 TAF6YGL112C 1551 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT3P36062 TCO89YPL180W 2400 nt5.54□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YCL046WYCL046W 324 nt5.54□□□□□ -1.52
AVT3P36062 PFF1YBR074W 2931 nt5.54□□□□□ -1.52
AVT3P36062 SPO75YLL005C 2607 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT3P36062 CTF4YPR135W 2784 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YPL044CYPL044C 549 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT3P36062 YOR1YGR281W 4434 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT3P36062 VAC7YNL054W 3498 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT3P36062 HAP1YLR256W 4509 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT3P36062 NIP100YPL174C 2607 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT3P36062 APC1YNL172W 5247 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT3P36062 SOM1YEL059C-A 225 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT3P36062 RPL33AYPL143W 324 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT3P36062 AIM44YPL158C 2277 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 NPR3YHL023C 3441 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 SAF1YBR280C 1914 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 STF2YGR008C 255 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 AI2Q0055 2565 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 SNT1YCR033W 3681 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT3P36062 RPS12YOR369C 432 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT3P36062 PBY1YBR094W 2262 nt5.49□□□□□ -1.53
AVT3P36062 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT3P36062 FMP46YKR049C 402 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT3P36062 GAL10YBR019C 2100 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT3P36062 YDR239CYDR239C 2364 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT3P36062 RPH1YER169W 2391 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT3P36062 RFX1YLR176C 2436 nt5.46□□□□□ -1.53
AVT3P36062 FMP16YDR070C 282 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT3P36062 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT3P36062 SPC98YNL126W 2541 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT3P36062 PEP3YLR148W 2757 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT3P36062 UBP11YKR098C 2154 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT3P36062 IKI3YLR384C 4050 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT3P36062 MRPL39YML009C 213 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT3P36062 TRK1YJL129C 3708 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT3P36062 EDS1YBR033W 2760 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT3P36062 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT3P36062 YCR043CYCR043C 384 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT3P36062 RPS25BYLR333C 327 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT3P36062 KRE5YOR336W 4098 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT3P36062 SRP14YDL092W 441 nt5.43□□□□□ -1.54
AVT3P36062 MDV1YJL112W 2145 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT3P36062 KSP1YHR082C 3090 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT3P36062 SEN1YLR430W 6696 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT3P36062 NOG1YPL093W 1944 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT3P36062 YNL144CYNL144C 2223 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT3P36062 YJL120WYJL120W 324 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT3P36062 NOC3YLR002C 1992 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT3P36062 STE23YLR389C 3084 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT3P36062 GAL11YOL051W 3246 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT3P36062 RIM15YFL033C 5313 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT3P36062 CDC31YOR257W 486 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT3P36062 UTP14YML093W 2700 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT3P36062 RPL31AYDL075W 342 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT3P36062 RPL42BYHR141C 321 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT3P36062 PDR10YOR328W 4695 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT3P36062 SPT23YKL020C 3249 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT3P36062 APL5YPL195W 2799 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT3P36062 snR76snR76 109 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT3P36062 RPL23BYER117W 414 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT3P36062 YNL114CYNL114C 372 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT3P36062 INP52YNL106C 3552 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT3P36062 HOS4YIL112W 3252 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT3P36062 YDL118WYDL118W 381 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT3P36062 DIA2YOR080W 2199 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT3P36062 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT3P36062 PIM1YBL022C 3402 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT3P36062 UBP14YBR058C 2346 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT3P36062 YOR019WYOR019W 2193 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT3P36062 RIC1YLR039C 3171 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT3P36062 PIP2YOR363C 2991 nt5.34□□□□□ -1.56
AVT3P36062 FAS1YKL182W 6156 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT3P36062 PAU3YCR104W 375 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms