Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5H1

TY1A-PR3, Transposon Ty1-PR3 Gag polyprotein, yeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ALK2	YBL009W	2031 nt		3.22	□□□□□ -1.89
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PUF4	YGL014W	2667 nt		3.22	□□□□□ -1.89
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ANB1	YJR047C	474 nt		3.21	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR140W	YLR140W	327 nt		3.21	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.21	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GCR1	YPL075W	2358 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	snR85	snR85	171 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGL069C	YGL069C	465 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MRPL39	YML009C	213 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNR042W	YNR042W	429 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FEX2	YPL279C	1128 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NPR3	YHL023C	3441 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SGD1	YLR336C	2700 nt		3.2	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RLI1	YDR091C	1827 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TOF2	YKR010C	2316 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR426C	YDR426C	378 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YIL020C-A	YIL020C-A	339 nt		3.19	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.18	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ORC1	YML065W	2745 nt		3.18	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LCD1	YDR499W	2244 nt		3.18	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJL135W	YJL135W	318 nt		3.18	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.18	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.18	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IPT1	YDR072C	1584 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FMP32	YFL046W	624 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YMR321C	YMR321C	318 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	VMA9	YCL005W-A	222 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IKI3	YLR384C	4050 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YAT2	YER024W	2772 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.17	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YKU70	YMR284W	1809 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PAN3	YKL025C	2040 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RRT15	YLR162W-A	189 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RTC6	YPL183W-A	282 nt		3.16	□□□□□ -1.9
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PRE4	YFR050C	801 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PSY2	YNL201C	2577 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJL070C	YJL070C	2667 nt		3.15	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GUP1	YGL084C	1683 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	snR76	snR76	109 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TRX1	YLR043C	312 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FPR1	YNL135C	345 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NUT2	YPR168W	474 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NAB3	YPL190C	2409 nt		3.14	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MPH1	YIR002C	2982 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RTC1	YOL138C	4026 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GIS4	YML006C	2325 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ERP6	YGL002W	651 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GRX8	YLR364W	330 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YBR224W	YBR224W	516 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNR065C	YNR065C	3351 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TSC11	YER093C	4293 nt		3.13	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MET5	YJR137C	4329 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	KSP1	YHR082C	3090 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	UPS1	YLR193C	528 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PTC5	YOR090C	1719 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SAK1	YER129W	3429 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	COS111	YBR203W	2775 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.12	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	VPH1	YOR270C	2523 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PEX8	YGR077C	1770 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGR164W	YGR164W	336 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR255C	YLR255C	354 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GOT1	YMR292W	417 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LSM7	YNL147W	348 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	EFR3	YMR212C	2349 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PDE2	YOR360C	1581 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TMN3	YER113C	2121 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.11	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CFT2	YLR115W	2580 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GLC3	YEL011W	2115 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	COA4	YLR218C	453 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RGM1	YMR182C	636 nt		3.1	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CDC27	YBL084C	2277 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YML037C	YML037C	1023 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YOR015W	YOR015W	360 nt		3.09	□□□□□ -1.91
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NUP120	YKL057C	3114 nt		3.09	□□□□□ -1.92
TY1A-PR3	Q6Q5H1	UBP11	YKR098C	2154 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FAP7	YDL166C	594 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SSS1	YDR086C	243 nt		3.08	□□□□□ -1.92
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.08	□□□□□ -1.92

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