Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTN1Q2MV58 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms