Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms