Protein–RNA interactions for Protein: Q12025

YDR056C, Uncharacterized protein YDR056C, yeastyeast

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR056CQ12025 IES5YER092W 378 nt2.35□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 COX13YGL191W 390 nt2.35□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 YLR171WYLR171W 390 nt2.35□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 DDR48YMR173W 1293 nt2.35□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 PPN1YDR452W 2025 nt2.35□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 YDL041WYDL041W 354 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 YDR286CYDR286C 345 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 ATP17YDR377W 306 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 ECL1YGR146C 636 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 BET3YKR068C 582 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 FYV7YLR068W 456 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 YML108WYML108W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
YDR056CQ12025 GIP3YPL137C 3831 nt2.34□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 VPS35YJL154C 2835 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SAP185YJL098W 3177 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 MSS11YMR164C 2277 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SCD5YOR329C 2619 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SGD1YLR336C 2700 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YHR125WYHR125W 306 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SEC22YLR268W 645 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 RUD3YOR216C 1455 nt2.33□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SVL3YPL032C 2478 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 RNH70YGR276C 1662 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 BI2Q0110 1272 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 COX7YMR256C 183 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 RTC6YPL183W-A 282 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 GPX2YBR244W 489 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YSW1YBR148W 1830 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SHE9YDR393W 1371 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 ASM4YDL088C 1587 nt2.32□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 UBP15YMR304W 3693 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YKR078WYKR078W 1758 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 MSB1YOR188W 3414 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YCR064CYCR064C 411 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 TMN3YER113C 2121 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YKR051WYKR051W 1257 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 TSC3YBR058C-A 243 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YPR039WYPR039W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 snR54snR54 86 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 STE11YLR362W 2154 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 VTC3YPL019C 2508 nt2.31□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 KAR3YPR141C 2190 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 CDC27YBL084C 2277 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 MGM1YOR211C 2646 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 VPS8YAL002W 3825 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YJL007CYJL007C 315 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 PSY1YKL076C 384 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YMR324CYMR324C 243 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SPO22YIL073C 2928 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SPF1YEL031W 3648 nt2.29□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 VPS41YDR080W 2979 nt2.29□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YCR001WYCR001W 315 nt2.29□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 snR79snR79 84 nt2.29□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 LSO2YGR169C-A 279 nt2.29□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SYM1YLR251W 594 nt2.29□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 PET309YLR067C 2898 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 PEX17YNL214W 600 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SPC29YPL124W 762 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 HER1YOR227W 3741 nt2.28□□□□□ -2.04
YDR056CQ12025 SSD1YDR293C 3753 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YDR341CYDR341C 1824 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 TOR1YJR066W 7413 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 TEN1YLR010C 483 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YLR053CYLR053C 327 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 RPS18BYML026C 441 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 snR13snR13 124 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 MNL2YLR057W 2550 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 NAM7YMR080C 2916 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 STB4YMR019W 2850 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 SMY1YKL079W 1971 nt2.27□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 SNF5YBR289W 2718 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 NUP120YKL057C 3114 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 SCH9YHR205W 2475 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 HOP2YGL033W 657 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YGL069CYGL069C 465 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 PEX4YGR133W 552 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 NBL1YHR199C-A 222 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 TMA10YLR327C 261 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 MLH1YMR167W 2310 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 BNI1YNL271C 5862 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 COS111YBR203W 2775 nt2.26□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 RPH1YER169W 2391 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 CAT2YML042W 2013 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YER121WYER121W 345 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 BRP1YGL007W 378 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YGL024WYGL024W 336 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 CMC2YBL059C-A 330 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 SYH1YPL105C 2550 nt2.25□□□□□ -2.05
YDR056CQ12025 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms