Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms