Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms