Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 CSF1YLR087C 8877 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YRB1YDR002W 606 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 FMP16YDR070C 282 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PAU14YIL176C 363 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PAU1YJL223C 363 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YAR068WYAR068W 486 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 RSA1YPL193W 1146 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 VPS52YDR484W 1926 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YJL070CYJL070C 2667 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 IRA2YOL081W 9240 nt2.32□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PTP3YER075C 2787 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YDL041WYDL041W 354 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YGR025WYGR025W 303 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 GRX8YLR364W 330 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 KTI11YBL071W-A 249 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 MSL5YLR116W 1431 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 ESL2YKR096W 3588 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 SEC26YDR238C 2922 nt2.31□□□□□ -2.04
SEF1P34228 HUR1YGL168W 333 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 VOA1YGR106C 798 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 RPL14BYHL001W 417 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 AYR1YIL124W 894 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PET191YJR034W 327 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PSY1YKL076C 384 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PAU8YAL068C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 TIF11YMR260C 462 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 PAU20YOL161C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 SWT1YOR166C 1377 nt2.3□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YFH1YDL120W 525 nt2.29□□□□□ -2.04
SEF1P34228 ATP17YDR377W 306 nt2.29□□□□□ -2.04
SEF1P34228 MZM1YDR493W 372 nt2.29□□□□□ -2.04
SEF1P34228 COX7YMR256C 183 nt2.29□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YNL010WYNL010W 726 nt2.29□□□□□ -2.04
SEF1P34228 MSS18YPR134W 807 nt2.29□□□□□ -2.04
SEF1P34228 MLH1YMR167W 2310 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 MRP10YDL045W-A 288 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YDR114CYDR114C 303 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 TIM9YEL020W-A 264 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 SMD1YGR074W 441 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 UTP30YKR060W 825 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YMR324CYMR324C 243 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 CDC33YOL139C 642 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YBR032WYBR032W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
SEF1P34228 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YER135CYER135C 393 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 AGA2YGL032C 264 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 RRF1YHR038W 693 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 NOP10YHR072W-A 177 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 IRC10YOL015W 1761 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 BFA1YJR053W 1725 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 ATG11YPR049C 3537 nt2.27□□□□□ -2.05
SEF1P34228 TAE2YPL009C 3117 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 snR56snR56 88 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 RPS17AYML024W 411 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 FYV12YOR183W 390 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YCL023CYCL023C 348 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 GIN4YDR507C 3429 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 RRP6YOR001W 2202 nt2.26□□□□□ -2.05
SEF1P34228 PDR1YGL013C 3207 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YPR097WYPR097W 3222 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 NIC96YFR002W 2520 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SCP160YJL080C 3669 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SPF1YEL031W 3648 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 CRG1YHR209W 876 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 RPS22BYLR367W 393 nt2.25□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SNX41YDR425W 1878 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 PDR11YIL013C 4236 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 VTC1YER072W 390 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 MSL1YIR009W 336 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 ERP4YOR016C 624 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 RTC6YPL183W-A 282 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 VPS35YJL154C 2835 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 CDC24YAL041W 2565 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SPC72YAL047C 1869 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 UBR1YGR184C 5853 nt2.24□□□□□ -2.05
SEF1P34228 TUS1YLR425W 3924 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YCR064CYCR064C 411 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 snR79snR79 84 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 NFU1YKL040C 771 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SEC22YLR268W 645 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 VTI1YMR197C 654 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 ZEO1YOL109W 342 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 RTT10YPL183C 3042 nt2.23□□□□□ -2.05
SEF1P34228 CDC53YDL132W 2448 nt2.22□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SSQ1YLR369W 1974 nt2.22□□□□□ -2.05
SEF1P34228 CDC50YCR094W 1176 nt2.22□□□□□ -2.05
SEF1P34228 YER121WYER121W 345 nt2.22□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SNC1YAL030W 354 nt2.22□□□□□ -2.05
SEF1P34228 SPO22YIL073C 2928 nt2.21□□□□□ -2.05
SEF1P34228 COX1Q0045 1605 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 IES5YER092W 378 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 LSO2YGR169C-A 279 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.21□□□□□ -2.06
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