Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARID3CA6NKF2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ARID3CA6NKF2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ARID3CA6NKF2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ARID3CA6NKF2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms