Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TRBV30A0A0K0K1B3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TRBV30A0A0K0K1B3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TRBV30A0A0K0K1B3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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