Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms