Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms