Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP3Q6Q6R5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms