Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YBR197CYBR197C 654 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 TMN3YER113C 2121 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 OSW7YFR039C 1533 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 HUR1YGL168W 333 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YKL111CYKL111C 336 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SIP18YMR175W 240 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YOR248WYOR248W 303 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SCD5YOR329C 2619 nt2.47□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SMY2YBR172C 2223 nt2.46□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YIL080WYIL080W 4722 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 AMS1YGL156W 3252 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 RPC10YHR143W-A 213 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 TIM8YJR135W-A 264 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 TSC3YBR058C-A 243 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 ASG1YIL130W 2895 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SNX41YDR425W 1878 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YKU80YMR106C 1890 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 BRO1YPL084W 2535 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 RGA2YDR379W 3030 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 AGA2YGL032C 264 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 PEX4YGR133W 552 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 NBL1YHR199C-A 222 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 RNP1YLL046C 750 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 ICY1YMR195W 384 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 CMC2YBL059C-A 330 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SLM6YBR266C 453 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 KRE33YNL132W 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 TOR1YJR066W 7413 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SMC6YLR383W 3345 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 ORC2YBR060C 1863 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 BTT1YDR252W 450 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 RAM2YKL019W 951 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 VPH2YKL119C 648 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YLR458WYLR458W 381 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 RPL36AYMR194W 303 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YOR105WYOR105W 327 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 ATP15YPL271W 189 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 MGR1YCL044C 1254 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YDR186CYDR186C 2634 nt2.44□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 TRS130YMR218C 3309 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YEF3YLR249W 3135 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YOL098CYOL098C 3114 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YPR089WYPR089W 2667 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 AAD16YFL057C 459 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 TEN1YLR010C 483 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SEN15YMR059W 387 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 ACM1YPL267W 630 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 MSS18YPR134W 807 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 KSP1YHR082C 3090 nt2.43□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SWA2YDR320C 2007 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SPO23YBR250W 1572 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YDR157WYDR157W 402 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YER135CYER135C 393 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YJL202CYJL202C 348 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 CCW14YLR390W-A 717 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YBR032WYBR032W 303 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 BUB1YGR188C 3066 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 PES4YFR023W 1836 nt2.42□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 SGM1YJR134C 2124 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YPK1YKL126W 2043 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YDL068WYDL068W 330 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 CAJ1YER048C 1176 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YGR050CYGR050C 357 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 RPL40AYIL148W 387 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 IRC19YLL033W 693 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YAR068WYAR068W 486 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 PEX17YNL214W 600 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 CDC33YOL139C 642 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 PRP6YBR055C 2700 nt2.41□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 HRD3YLR207W 2502 nt2.4□□□□□ -2.02
YBL055CP34220 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.4□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 IES5YER092W 378 nt2.4□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.4□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 NUP82YJL061W 2142 nt2.4□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 snR13snR13 124 nt2.4□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YPR039WYPR039W 336 nt2.4□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 SIR3YLR442C 2937 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 SCP160YJL080C 3669 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YJL016WYJL016W 1686 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YGR025WYGR025W 303 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 NCE101YJL205C 162 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 PSY1YKL076C 384 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 LCL2YLR104W 396 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 LEE1YPL054W 906 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 RSA1YPL193W 1146 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YNL018CYNL018C 1839 nt2.39□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 CSF1YLR087C 8877 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 INP51YIL002C 2841 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YJL181WYJL181W 1836 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 TRA1YHR099W 11235 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 snR56snR56 88 nt2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.4 ms