Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 PEP8YJL053W 1140 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 UBX4YMR067C 1251 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 MET18YIL128W 3099 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 RUD3YOR216C 1455 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 SPR3YGR059W 1539 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 SCD5YOR329C 2619 nt2.31□□□□□ -2.04
BRF1P29056 CMS1YLR003C 876 nt2.3□□□□□ -2.04
BRF1P29056 LOA1YPR139C 903 nt2.3□□□□□ -2.04
BRF1P29056 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
BRF1P29056 VPH1YOR270C 2523 nt2.3□□□□□ -2.04
BRF1P29056 ATG9YDL149W 2994 nt2.3□□□□□ -2.04
BRF1P29056 DPB11YJL090C 2295 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 CRD1YDL142C 852 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 MET32YDR253C 576 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 PRM8YGL053W 714 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 YLR458WYLR458W 381 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 CSI1YMR025W 888 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 TOA1YOR194C 861 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 BUD2YKL092C 3315 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 RRP6YOR001W 2202 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 SSQ1YLR369W 1974 nt2.29□□□□□ -2.04
BRF1P29056 TIM10YHR005C-A 282 nt2.28□□□□□ -2.04
BRF1P29056 RAM2YKL019W 951 nt2.28□□□□□ -2.04
BRF1P29056 RMP1YLR145W 606 nt2.28□□□□□ -2.04
BRF1P29056 PHO80YOL001W 882 nt2.28□□□□□ -2.04
BRF1P29056 SSD1YDR293C 3753 nt2.28□□□□□ -2.04
BRF1P29056 VPS8YAL002W 3825 nt2.28□□□□□ -2.04
BRF1P29056 HNT1YDL125C 477 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 IRC4YDR540C 540 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 CIC1YHR052W 1131 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YKR051WYKR051W 1257 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RPB11YOL005C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 TRS20YBR254C 528 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 MGR1YCL044C 1254 nt2.27□□□□□ -2.05
BRF1P29056 PDR8YLR266C 2106 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RNR4YGR180C 1038 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RPL40AYIL148W 387 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 APQ13YJL075C 417 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YKL044WYKL044W 321 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YLR379WYLR379W 375 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 AIM32YML050W 936 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 Q0017Q0017 162 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YJL070CYJL070C 2667 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 DNF1YER166W 4716 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 MDM32YOR147W 1869 nt2.26□□□□□ -2.05
BRF1P29056 PUT3YKL015W 2940 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 PHR1YOR386W 1698 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 BRO1YPL084W 2535 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 KAP123YER110C 3342 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YFR056CYFR056C 369 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YPS5YGL259W 498 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 SPC1YJR010C-A 285 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 ATP7YKL016C 525 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YPL039WYPL039W 951 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 SAP190YKR028W 3102 nt2.25□□□□□ -2.05
BRF1P29056 MPH1YIR002C 2982 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 TRL1YJL087C 2484 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 SHE2YKL130C 741 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 URA10YMR271C 684 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YOR105WYOR105W 327 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 SVS1YPL163C 783 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 SNU56YDR240C 1479 nt2.24□□□□□ -2.05
BRF1P29056 UBP11YKR098C 2154 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 NAN1YPL126W 2691 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RTR2YDR066C 591 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RPL37AYLR185W 267 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 ATX2YOR079C 942 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 SPP41YDR464W 4308 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 UTP13YLR222C 2454 nt2.23□□□□□ -2.05
BRF1P29056 REV1YOR346W 2958 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 MGA2YIR033W 3342 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 NIC96YFR002W 2520 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 FMP16YDR070C 282 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 YDR220CYDR220C 294 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RPS24AYER074W 408 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 EAF6YJR082C 342 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 TMA7YLR262C-A 195 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 UBP2YOR124C 3819 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 PTC5YOR090C 1719 nt2.22□□□□□ -2.05
BRF1P29056 RPS7BYNL096C 573 nt2.21□□□□□ -2.06
BRF1P29056 ATG11YPR049C 3537 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 USO1YDL058W 5373 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 RPA34YJL148W 702 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 LSM7YNL147W 348 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YPL197CYPL197C 414 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 ATP15YPL271W 189 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 SAC3YDR159W 3906 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 CAT2YML042W 2013 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 RRP12YPL012W 3687 nt2.2□□□□□ -2.06
BRF1P29056 MMS22YLR320W 4365 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 NCL1YBL024W 2055 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 TOR2YKL203C 7425 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 SPE1YKL184W 1401 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 RPL9AYGL147C 576 nt2.19□□□□□ -2.06
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