Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TK1P04183 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TK1P04183 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TK1P04183 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TK1P04183 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TK1P04183 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TK1P04183 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TK1P04183 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TK1P04183 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms