Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYVE1Q9Y5Y7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYVE1Q9Y5Y7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYVE1Q9Y5Y7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYVE1Q9Y5Y7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYVE1Q9Y5Y7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LYVE1Q9Y5Y7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYVE1Q9Y5Y7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYVE1Q9Y5Y7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms