Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF12Q9Y4X4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF12Q9Y4X4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF12Q9Y4X4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF12Q9Y4X4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLF12Q9Y4X4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms