Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD3Q9Y3P4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDD3Q9Y3P4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDD3Q9Y3P4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDD3Q9Y3P4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms