Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms