Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
ALKQ9UM73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ALKQ9UM73 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ALKQ9UM73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ALKQ9UM73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ALKQ9UM73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ALKQ9UM73 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ALKQ9UM73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ALKQ9UM73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ALKQ9UM73 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ALKQ9UM73 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ALKQ9UM73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ALKQ9UM73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ALKQ9UM73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms