Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYH13Q9UKX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYH13Q9UKX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
MYH13Q9UKX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MYH13Q9UKX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
MYH13Q9UKX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH13Q9UKX3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
MYH13Q9UKX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms