Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ADAM28Q9UKQ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ADAM28Q9UKQ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ADAM28Q9UKQ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ADAM28Q9UKQ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ADAM28Q9UKQ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ADAM28Q9UKQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms