Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD1Q9UIS9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MBD1Q9UIS9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD1Q9UIS9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MBD1Q9UIS9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD1Q9UIS9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD1Q9UIS9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms