Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPN3Q9UHW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPN3Q9UHW5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPN3Q9UHW5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPN3Q9UHW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPN3Q9UHW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPN3Q9UHW5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms