Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KLHL3Q9UH77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL3Q9UH77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL3Q9UH77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL3Q9UH77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL3Q9UH77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms