Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNOT8Q9UFF9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT8Q9UFF9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT8Q9UFF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT8Q9UFF9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT8Q9UFF9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNOT8Q9UFF9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms