Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP1Q9P0U3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP1Q9P0U3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP1Q9P0U3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP1Q9P0U3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms