Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED11Q9P086 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED11Q9P086 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED11Q9P086 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED11Q9P086 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED11Q9P086 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED11Q9P086 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED11Q9P086 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED11Q9P086 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms