Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD3Q9NY59 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD3Q9NY59 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD3Q9NY59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD3Q9NY59 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD3Q9NY59 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD3Q9NY59 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD3Q9NY59 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD3Q9NY59 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms