Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHL11Q9NVR0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL11Q9NVR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL11Q9NVR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KLHL11Q9NVR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL11Q9NVR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms