Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM138Q9NPI0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM138Q9NPI0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM138Q9NPI0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM138Q9NPI0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM138Q9NPI0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms