Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PRXQ9BXM0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
PRXQ9BXM0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PRXQ9BXM0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.29■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PRXQ9BXM0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PRXQ9BXM0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PRXQ9BXM0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PRXQ9BXM0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRXQ9BXM0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.19■■■■■ 4.51
PRXQ9BXM0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
PRXQ9BXM0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
PRXQ9BXM0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PRXQ9BXM0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
PRXQ9BXM0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
PRXQ9BXM0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PRXQ9BXM0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms