Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf16Q9BUW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9orf16Q9BUW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf16Q9BUW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9orf16Q9BUW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf16Q9BUW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf16Q9BUW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms