Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX7

TTPAL, Alpha-tocopherol transfer protein-like, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPALQ9BTX7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTPALQ9BTX7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTPALQ9BTX7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTPALQ9BTX7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTPALQ9BTX7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTPALQ9BTX7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTPALQ9BTX7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTPALQ9BTX7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms