Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT2

UQCC2, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC2Q9BRT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UQCC2Q9BRT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UQCC2Q9BRT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC2Q9BRT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UQCC2Q9BRT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCC2Q9BRT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms