Protein–RNA interactions for Protein: Q96QI5

HS3ST6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST6Q96QI5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS3ST6Q96QI5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS3ST6Q96QI5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HS3ST6Q96QI5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HS3ST6Q96QI5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS3ST6Q96QI5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS3ST6Q96QI5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS3ST6Q96QI5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms