Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNT1Q96Q11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNT1Q96Q11 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNT1Q96Q11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNT1Q96Q11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNT1Q96Q11 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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