Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRERF1Q96PN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRERF1Q96PN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRERF1Q96PN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRERF1Q96PN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRERF1Q96PN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRERF1Q96PN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRERF1Q96PN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
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