Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC136Q96JN2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC136Q96JN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC136Q96JN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC136Q96JN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC136Q96JN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC136Q96JN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC136Q96JN2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms