Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC4Q96FT7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC4Q96FT7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC4Q96FT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ASIC4Q96FT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms