Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VTI1AQ96AJ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VTI1AQ96AJ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VTI1AQ96AJ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VTI1AQ96AJ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VTI1AQ96AJ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VTI1AQ96AJ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VTI1AQ96AJ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms